精密空調和普通空調的區別體現在很多方面：
普通空調，由于送風量小，換氣次數少，機房內空氣不能保證有足夠高的流速將塵埃帶回到過濾器上，而在機房設備內部產生沉積，對設備本身產生不良影響。且一般舒適性空調機組的過濾性能較差，不能滿足計算機的凈化要求。
精密空調
采用機房精密空調送風量大，空氣循環好，同時因具有的空氣過濾器，能及時的濾掉空氣中的塵挨，保持機房的潔凈度。
普通空調風量小，風速低，只能在送風方向局部氣流循環，不能在機房形成整體的氣流循環，機房冷卻不均勻，使得機房內存在區域溫差，送風方向區域溫度低，其他區域溫度高，發熱設備因擺放位置不同而產生局部熱量積累，導致設備過熱損壞。
機房精密空調送風量大，機房換氣次數高（通常在30～60次/小時），整個機房內能形成整體的氣流循環，使機房內的所有設備均能平均得到冷卻。
普通空調主要是針對于人員設計，送風量小，送風焓差大，降溫和除濕同時進行；而機房內顯熱量占全部熱量的90%以上，它包括設備本身發熱、照明發熱量、通過墻壁、天花、窗戶、地板的導熱量，以及陽光輻射熱，通過縫隙的滲透風和新風熱量等。
精密空調
機房精密空調在設計上采用嚴格控制蒸發器內蒸發壓力，增大送風量使蒸發器表面溫度高于空氣露點溫度而不除濕，產生的冷量全部用來降溫，提高了工作效率，降低了濕量損失（送風量大，送風焓差減?。?。
機房精密空調與普通空調在產品設計方面存在顯著差別，二者為不同的目的而設計，無法互換使用。